MaxENT生态位模型:建模、参数优化、个性化分析

MaxEnt模型基于最大熵原理,即在满足已知约束的条件下,选择熵最大的模型,它利用物种的存在分布点和环境变量,来推算物种的生态需求和模拟物种的潜在分布。MaxEnt由于其简单直接的操作、简洁清晰的图形界面及参数自动配置的功能,被广大研究者特别是初学者所青睐。

那如何使用MaxEnt模型?如何对物种适宜生境分布进行预测,并制作物种适宜生境分布图?如何对参数如何优化?如何利用MaxEnt模型发表高质量论文,创新点在哪里?

  1. MaxEnt软件下载安装;
  2. ArcGIS软件安装和参数设置;
  3. ENMtool软件安装;
  4. R软件的安装;

数据文件准备和处理

  1. 物种分布数据的获取途径和处理方法介绍;
  2. Wordclim网站环境数据介绍和下载方法;
  3. 常用生物环境变量数据的获取途径和处理方法介绍;
  4. 基础地图数据的获取途径介绍;

MaxEnt建模预测

  1. MaxEnt软件界面说明和参数说明;
  2. 基于MaxEnt模型的基础分布预测教程;
  3. 结果文件说明;

MaxEnt对海洋生物的模拟分析

1.海洋生物经典案例文章解析

2.海洋环境数据库说明和数据下载处理

3.海洋生物适宜区建模与制图

4.海洋生物研究特点和注意事项

  1. 物种分布数据的筛选—剔除冗余数据避免过拟合;
    1. 基于缓冲区法筛选分布数据
    2. 基于ENMtool工具筛选分布数据
  2. 环境因子的相关性分析和筛选;

2.1 基于SPSS软件对环境因子的相关性分析;

2.2 基于ENMtool软件对环境因子的相关性分析;

2.3 基于R绘制相关性分析热图;

2.4 分析结果解读和环境因子筛选;

R优化MaxEnt模型参数

  1. MaxEnt模型参数优化文章解读;
  2. R脚本解读和R包安装;
  3. 基于R优化MaxEnt参数操作教程
  4. 基于R对MaxEnt的优化结果解读
  5. 基于优化结果对物种的适生区预测;
  6. 适生区面积计算

制图

  1. 研究区域制图;
  2. 物种分布点或采样点制图;

MaxENT生态位模型:建模、参数优化、个性化分析

MaxEnt建模预测-个性化分析

  1. SDMtool工具安装和介绍;
  2. 不同时期物种分布中心坐标计算和转移路线距离分析(质心转移)
  3. 不同时期物种的适生区面积变化计算和制图分析;
  4. 不同物种生态位重合度(range overlap)计算分析;
  5. 不同物种地理分布重合度(Niche overlap)计算分析

  6. 树谷资料库资源大全(10月18日更新)

 

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